【補助事業】
１ 河川流域振興活動実践事業
内水面漁業・養殖業の振興を図るとともに内水面資源の活用と地域の活性化を目的として内水面利用者に知識技術の啓発普及を行うための事業を行います。主に学童を対象とした体験学習会や地元住民を対象とした河川清掃や釣り教室をはじめとする事業を各県漁連とともに事業計画を策定し実施するほか、ます類等の内水面養殖魚の消費拡大を目的とした活動を行います。
２ 緊急・広域外来魚等対策事業
ブラックバス等の外来魚及びカワウによる漁業被害の防止又は軽減を図るため、緊急的・広域的な防除や駆除等を本会会員等が行うための補助金交付を行うほか、円滑かつ効果的な緊急・広域対策の推進を図るため、漁業関係者等による協議会を開催するとともに必要な指導等を行います。
・外来魚およびカワウのこれまでの駆除数について
【委託事業】
１ 漁場環境調査指針作成事業
本事業では、河川中下流域に於いて、漁業および遊漁の対象として国民の関心の高いアユを対象に漁場環境の改善を促進するための漁場環境調査指針を作成します。全国内水面漁連は、この事業の評価・検討を行うための有識者で構成される検討委員会を設置し、調査・研究に助言を与えると共に調査・研究の内容について検討を行って水産庁に報告します。
２ 渓流資源増大技術開発事業
本事業は、天然水域における渓流魚（イワナ、ヤマメ・アマゴなど）の遺伝子の状況を把握し、遺伝的多様性の増大・維持技術および原種の活用技術を開発します。全国内水面漁連は、この事業の評価・検討を行うための有識者で構成される検討委員会を設置し、調査・研究に助言を与えると共に調査・研究の内容について検討を行って水産庁に報告します。
３ 外来魚抑制管理技術開発事業
本事業では、在来魚と共存できる外来魚の個体密度、共存機構を明らかにするとともに外来魚の現存量を把握する技術、外来魚の生息状況に応じた駆除技術を開発します。全国内水面漁連は、この事業の評価・検討を行うための有識者で構成される検討委員会を設置し、調査・研究に助言を与えると共に調査・研究の内容について検討を行って水産庁に報告します。
・補助事業（緊急・広域外来魚等対策事業）に係る不適正な経理処理に対する措置について
